秦灶街道地处南通市北郊，通吕运河北岸，港闸区的东部，素有南通“北大门”之称。该街道南与崇川区钟秀街道接壤，东和北与通州市兴仁镇毗邻，西与港闸区唐闸街道、幸福街道隔河相依。通吕运河、南通外环北路、长岸路、怡园路、站前路横穿东西，英雄竖河、江通公路、南通市中轴线工农北路延伸段、通京大道、国强路、石桥路纵穿南北，水陆交通便捷。